跳到主要內容區塊
  • project1

    園區核心設施

    NBRP Core Facilities

園區核心設施 - 生醫轉譯研發團隊的後盾 園區核心設施,已開放對外服務,歡迎產學研單位申請使用

:::

循環腫瘤細胞擷取與基因檢測平台

介紹:

此平台主要應用於各式微量樣本篩選、單一細胞基因分析、微量核酸絕對定量以及相對定量分析。

微流體型循環腫瘤細胞篩選系統 (Fluxion IsoFlux System)的主要特點,可從小量的生物樣品(如: 血液、尿液..等)中篩選並收集數量極少的罕見細胞,相較於使用類似流式細胞儀等分選儀器,皆需要大量的生物樣品,此儀器利用微流體技術(Microfluidic channel),搭配原廠(Fluxion)的試劑,讓使用者可獲取微量且高密度的罕見細胞族群,並可接續微量單細胞定序基因製備系統(Fluidigm C1™ Single-Cell Auto Prep System),在此平台上製備所需之單一細胞的DNA/RNA模板,用於mRNA定序、DNA定序、表觀遺傳學或miRNA表達檢測。同時,針對基因檢測的服務,本核心設施建構了digital PCR系統以提供微量絕對定量方法,並備有24小時開放的即時定量偵測系統(real-time PCR)提供使用者使用。

國家生技園區生醫轉譯核心共儀設施內設置有微流體型循環腫瘤細胞篩選系統 (Fluxion IsoFlux System)、1台微量單細胞定序基因製備系統(Fluidigm C1™ Single-Cell Auto Prep System)、1台數位精準定量核酸分析儀(Bio-Rad QX200 Droplet Digital PCR System)以及 2台微電腦超快速梯度控溫型核酸擴增儀組(ABI Q5/384 & Bio-Rad CFX96/384)。相關配備: BSL1、BSL2(A512)實驗室、細胞操作台與培養房。

服務項目:

  1. 委託專案服務
  2. 專人操作服務
  3. 儀器自行操作
  4. 諮詢與教育訓練服務

開放時間:

週一至週五 09:00~17:00 

儀器預約日曆

微流體型循環腫瘤細胞篩選系統

  • 型號:Fluxion Biosciences Isoflux system
  • 儀器簡介: 利用微流體技術(Microfluidic channel)搭配原廠(Fluxion)的試劑,不但保有免疫磁珠法(Magnetic Beads)的高回收率及靈活度,更提升了細胞通過數量,有利於篩選並收集數量極少的罕見細胞,例如:循環腫瘤細胞(CTCs)的篩選。
  • 樣品型式:血液或各式微量樣品皆可,需搭配原廠提供試劑與微流體晶片耗材。耗材可自備或共儀收費提供。
  • 儀器放置位置: 國家生技研究園區 A棟 5樓 A512
  • 儀器照片:

 

原廠連結

 

微量單細胞定序基因製備系統

  • 型號: Fluidigm C1™ Single-Cell Auto Prep System
  • 儀器簡介: 藉由拋棄式微流道晶片針對單一細胞進行獨立分離,單一細胞於晶片中可完成細胞裂解(lysis)、RNA 純化(RNA purification)、反轉錄作用(Reverse transcription)和擴增放大(pre-amplify),最後將單一細胞之終產物流放之單一細胞槽中,可回收做進一步分析
  • 應用範圍:單一細胞基因表現(Single-Cell Gene Expression)、mRNA定序、DNA定序、表觀遺傳學或miRNA表達檢測
  • 樣品型式:DNA Seq, mRNA Seq和mRNA Seq HT
  • 晶片選擇: 針對不同細胞大小有3種尺寸 (耗材自備)
    • 5~10 µm
    • 10~17 µm
    • 17~25 µm
  • 儀器放置位置: 國家生技研究園區 A棟 5樓 A512
  • 儀器照片:

原廠連結

 

 

基因表達分析儀

型號:BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System

儀器特點: 

           細胞上樣系統

A 單顆磁珠具有專利技術的分子索引核酸序列 (Molecular Indexing),可以精準計算基因原始套數(Copy Number)。

B 標的基因分析(Targeted Assays)及多重樣本試劑組(Sample Multiplexing Kit),具有NGS較少讀取(reads)需求、低表達基因的較高敏感度及解析度,以及較少的時間需要和成本付出。全基因組分析 (Whole Transcriptome Assay, WTA)則應 用於研究及發現階段的需求。

C 以磁珠純化的cDNA可以保存12個星期以上,無需立即做NGS (Next Generation Sequencing)分析,有最為彈性的時間運用。                                     

細胞影像掃瞄系統

A光源:LED 482nm及635nm波長激發,其螢光偵測範圍:綠光513nm-563nm;紅光662.5nm-707nm。。

         B 影像模式:明視野影像 (Bright field), 530nm

         D 可計數活細胞濃度(cell/ul)、死細胞濃度(cell/ul)、 總細胞濃度(cell/ul)及活細胞百分比,以精確控制其後的分析為活細胞的基因表達。

         E 可計數細胞卡匣中每一個微孔具有單顆磁珠的數目及效率。

         F 可計數磁珠取抓單顆活細胞的數目、停滯比例、抓取複數細胞(單顆磁珠抓取2顆以上的細胞)百分比,以提供嚴格的品管控制。

儀器操作:受正式教育訓練核可後自行操作與專人操作服務等,並依據需求訂定專案處理

 

數位精準定量核酸分析儀

  • 型號: Bio-Rad QX200 Droplet Digital PCR System
  • 儀器配備:
    • QX200 droplet generator
    • QX200 droplet reader
  • 使用說明:
    • 耗材自備
    • 樣品上樣的體積只需 20 ul
    • 可同時讀取兩種色光訊號: FAM and VIC
    • 可直接運算目標樣品含量,無需標準品
    • 可針對含量稀少品進行偵測,即使目標樣品佔所有樣品的 0.001% ,靈敏度更勝 qPCR
    • 可針對基因複製套數進行準確的偵測,靈敏度再勝 qPCR
    • 可針對 NGS 前端樣品置備或是後端 Data 再確認,提供準確的結果
  • 儀器放置位置:國家生技研究園區 A棟 5樓 504室
  • 儀器照片:

原廠連結

微電腦超快速梯度控溫型核酸擴增儀組- ABI Q5/384

  • 型號: ABI QuantStudio 5 Real-Time PCR System 384-well
  • 使用說明:
    • 耗材自備
    • 具有Multiplex功能,可同時定量多個基因,大幅縮短實驗時間及提高數據品質
    • 高通量的384孔加熱槽最低反應體積僅需要5ul,可大幅降低珍貴樣品的使用量
    • 儀器具有“快速模式(Fast Mode)”及“標準模式(Standard Mode)”兩種升降溫模式可供選擇,快速模式40 Cycles的實驗最快可在35分鐘內完成
    • 內建“相對定量軟體”,可輕鬆進行不同樣品間基因表現差異的運算,且不需再另行於excel軟體裡人工運算,大量縮短實驗結果的處理時間
    • 此機器所搭配之軟體具有自動查驗實驗數據的功能(QC Summary),可避免因人為因素所造成實驗的誤判
  • 儀器放置位置:國家生技研究園區 A棟 5樓 A504
  • 儀器照片:

原廠連結

微電腦超快速梯度控溫型核酸擴增儀組- Bio-Rad CFX96/384

  • 型號: Bio-Rad CFX96 Touch™ Real-Time PCR Detection System
  • 使用說明:
    • 耗材自備
    • 可使用96×0.2ml tubes,96-well PCR plate,12×8-tube strips 以及 384-well plate
    • 6種螢光種類: Fluorescein (FAM)、 SYBR Green、HEX、Texas Red、ROX 及 Cy5 等,並可適應新開發之螢光種類,例如:Cal gold 540、Cal red 610、Quasar 670 及 Quasar 705
    • 基因表現分析: 相對定量軟體具備多重參考基因評估功能
  • 儀器放置位置:國家生技研究園區 A棟 5樓 A504
  • 儀器照片:

原廠連結

毛細管電泳分析儀

專案經理: 陳志龍 博士  |  jyhlong@gate.sinica.edu.tw

辦公室: 國家生技研究園區A棟 A441  |  02-7750-5554